Сергей Никоненко родился 16 апреля 1941 года в Москве в семье шофёра и стеклодувщицы. В младенчестве во время войны он жил с матерью в партизанском отряде. Детство актёра прошло в доме, где когда-то жила первая жена Есенина Анна Изряднова. В юности его сравнивали с поэтом из-за внешнего сходства / Галина Кмит / РИА Новости
В детстве будущий актёр занимался в драмкружке, учился в музыкальной школе по классу аккордеона, участвовал в художественной самодеятельности / РИА Новости
Актёрское образование Никоненко получил во ВГИКе, в мастерской Сергея Герасимова и Тамары Макаровой. На том же курсе учились Лидия Федосеева, Евгений Жариков, Николай Губенко, Галина Польских и другие впоследствии прославившиеся актёры / Кадр из фильма «Звонят, откройте дверь» (1965) / Mosfilm / Legion-Media
Сергей Никоненко окончил вуз в 1964 году и устроился в Театр-студию киноактёра. У него уже был опыт съёмок: артист исполнил небольшие роли в фильмах «Сердце не прощает», «Люди и звери», «Улица Ньютона, дом 1» и других / Кадр из фильма «Звезды и солдаты» (1967) / Mosfilm / Legion-Media
Никоненко играл героев второго плана в ряде знаковых проектов 1960-х — «Война и мир: 1812 год», «Дворянское гнездо», двух фильмах цикла «Освобождение». В ленте «Пой песню, поэт...» (1971) он воплотил образ Сергея Есенина. Эту роль ему ещё в студенчестве предсказывал Сергей Герасимов / РИА Новости
На рубеже 1960-х и 1970-х Сергей Никоненко вернулся во ВГИК и получил режиссёрское образование / Кадр из фильма «Красная площадь» (1970) / Mosfilm / Legion-Media
В 1974 году Никоненко ушёл из театра, чтобы сосредоточиться на кино. Тогда же он дебютировал как постановщик полного метра с фильмом «Птицы над городом» / Кадр из фильма «Трын-трава» (1976) / Mosfilm / Legion-Media
В 1980-х и 1990-х Сергей Никоненко исполнил роли в картинах «Завтра была война», «Инспектор ГАИ», «Шестой», «Сталинград», «Классик» / Кадр из фильма «Китайский сервиз» (1999) / Mosfilm / Legion-Media
В конце 1990-х актёр начал сниматься в популярном сериале «Каменская». К роли полковника Гордеева он возвращался на протяжении всех шести сезонов / На съёмках телесериала «Каменская» / Persona Stars / Legion-Media
В 2000 году Никоненко вернулся в театр. Первой его ролью этого периода стал Чапаев в спектакле «Чапаев и Пустота». В дальнейшем артист участвовал во многих антрепризных постановках / Никоненко на сцене в спектакле «Ханума» вместе с актёром Гурамом Баблишвили / Legion-Media
Сергей Никоненко — народный артист РСФСР, кавалер ордена «За заслуги перед Отечеством» III и IV степеней, ордена Почёта, лауреат премии Ленинского комсомола. «Сергей Никоненко не просто большой актёр — он большой русский актёр» — так оценил его деятельность писатель Юрий Поляков / Михаил Воскресенский / РИА Новости
С 1972 года Никоненко женат на актрисе Екатерине Ворониной. Их сын Никанор Никоненко также пробовал себя в актёрстве и режиссуре. В 1994 году Сергей Никоненко вместе с супругой создал Есенинский культурный центр, занимающийся сохранением памяти и творческого наследия поэта / Наталья Логинова / PhotoXPress.ru / Legion-Media